Vi kan dog identificere nogle områder, hvor Finney mødte modstand og kritik:
* Hans vægt på "nye foranstaltninger" inden for vækkelse: Finneys metoder, som brugen af "ængstelige bænke" og "langvarige møder", blev betragtet som radikale af nogle traditionalistiske præster. Han blev anklaget for at være for følelsesladet og manipulerende, og hans teknikker udløste kontrovers.
* Hans syn på sociale reformer: Finney var en stærk fortaler for afskaffelse og afholdenhed, hvilket satte ham på kant med nogle dele af samfundet, der havde modsatrettede synspunkter.
* Hans kontroverser inden for den presbyterianske kirke: Finneys vægt på "fri vilje" og hans uortodokse synspunkter om prædestination forårsagede spændinger inden for den presbyterianske kirke, hvilket i sidste ende førte til hans adskillelse fra kirkesamfundet.
* Hans kampe med mental sundhed: Finney oplevede perioder med depression og angst gennem hele sit liv, hvilket til tider påvirkede hans tjeneste.
* Hans indflydelse på det moderne evangeliske landskab: Selvom Finneys arv er enorm, hævder nogle kritikere, at hans vægt på personlig omvendelse og emotionalitet i sidste ende bidrog til fremkomsten af en mere individualistisk og mindre socialt engageret form for evangelisering.
Det er vigtigt at huske, at disse er fortolkninger af historiske begivenheder. Finneys fiaskoer var ikke nødvendigvis personlige mangler, men snarere stridspunkter inden for konteksten af hans tid og det fremherskende religiøse og sociale landskab.
I sidste ende var Charles G. Finneys liv og tjeneste komplekst og mangefacetteret, og mens han oplevede udfordringer og kontroverser, satte han også et ubestrideligt præg på den amerikanske religions historie.