Dette var et smart nikk til den berygtede B-filmregissør Ed Wood, kendt for sit lavbudget, ofte campy film. Hughes brugte dette pseudonym til manuskripter, som han ikke ønskede at være direkte forbundet med, eller måske for dem, som han betragtede som mindre alvorlig end hans andet arbejde.
For eksempel brugte han "Ed Wood Jr." til manuskriptet af "National Lampoon's Vacation" (1983). Det er interessant at bemærke, at dette pseudonym også blev brugt til filmens efterfølger "National Lampoon's European Vacation" (1985).
Mens han var kendt for sine ikoniske teen -komedier, skrev han også andre genrer og brugte undertiden et pseudonym til at adskille sig fra "John Hughes" -mærket.