I filmen nægter Peter Pan at blive voksen. Han bor i Neverland, et sted, hvor der ikke er tid og regler. Han bruger sine dage på at lege med Lost Boys og kæmpe mod pirater. Da Wendy og hendes børn kommer til Neverland, bliver Peter tvunget til at konfrontere den virkelighed, at han ikke kan forblive et barn for evigt. Han skal til sidst vokse op og vende tilbage til den virkelige verden.
Gennem rejsen i filmen præsenterer "Hook" Peter for svære udfordringer, der tvinger ham til at modnes. Gennem hele filmen må Peter Pan tage sit ansvar i øjnene og lære værdifulde livslektioner om at vokse op, tage ansvar for sine handlinger og vigtigheden af familie og forhold. I sidste ende overvinder han sin frygt for voksenlivet og bliver en ansvarlig far og partner, mens han stadig inkarnerer mange kvaliteter i hans barndom og barnlige ånd, såsom uskyld, fantasi, positivitet, eventyr.