Hvad er Jacobsen-indekset?

Jacobsen-indekset for et fylogenetisk træ er et mål for dets forgrening, eller i hvilken grad træet indeholder korte indre grene. Det er defineret som forholdet mellem den samlede trælængde (summen af ​​længderne af alle grene i træet) og den mindst mulige trælængde, som er længden af ​​et træ med det samme antal taxa og ingen indre grene ( alle taxa er forbundet direkte til roden).

Et højt Jacobsen-indeks indikerer et træ med mange korte indre grene, som kan være resultatet af en hurtig udstråling af taxa eller en høj karakterudvikling. Et lavt Jacobsen-indeks indikerer et træ med få korte indre grene, hvilket kan være resultatet af en langsom udstråling af taxa eller en lav karakterudvikling.

Jacobsen-indekset bruges ofte til at sammenligne den relative forgrening af forskellige fylogenetiske træer og kan bruges til at vurdere tilpasningen af ​​forskellige evolutionære modeller til et givet datasæt.